Groupe de recherche Méthodes Formelles pour la Bioinformatique

Équipe

Responsable de l’équipe : Olivier ROUX

Domaine de recherche

MeForBio (Méthodes Formelles pour la Bioinformatique) est un groupe de recherche en bioinformatique dans le domaine de la formalisation et du raisonnement automatique du traitement des données et des systèmes avec des caractéristiques temporelles. MeForBio est particulièrement orientée vers l'élaboration des cadres et méthodes qui modèlent et analysent des systèmes biologiques. L'équipe se focalise principalement sur :

• La complexité de la dynamique des systèmes vivants
• La simulation (non-déterministe) et le raisonnement (complet et exhaustif) sur un modèle décrivant un système biologique
• La modélisation de la réponse à l'état stationnaire d'une perturbation sur un système biologique de grande taille
• L'intégration des données expérimentales à haut débit dans des réseaux de régulation à grande échelle
• La formalisation automatique des connaissances dans les bases de données de réactions biochimiques

Sujets de recherche

• Modélisation dynamique
• Modélisation statique
• Formalisation de la Connaissance Biologique

Les principaux axes de recherche de MeForBio comprennent des méthodes pour proposer des analyses sur des modèles dynamiques et statiques des systèmes biologiques basés sur des modèles discrets, ainsi que des méthodes pour obtenir automatiquement des modèles discrets à partir des connaissances stockées dans des bases de données sur les régulations entre molécules.