Soutenance HDR d'Aurélien Sérandour

Aurélien Sérandour, Maître de conférences à Centrale Nantes présentera ses travaux en vue d’obtenir l’Habilitation à Diriger des Recherches le 23 juin 2026 à 13h à Centrale Nantes (Amphithéâtre S) sur le sujet : Épigénomique et criblage génétique pour l’étude des pathologies.

Rapporteurs avant soutenance :

• Nathalie GABORIT Directrice de Recherche CNRS, Nantes Université, Institut du Thorax
• Jean MOSSER PU-PH, Université de Rennes, Inserm OSS
• Paul PEIXOTO Maître de conférences, Université Marie-et-Louis-Pasteur, Inserm RIGHT

Examinateurs :

• Philippe JUIN, Directeur de recherche à l'Inserm, Nantes Université, CRCI2NA
• Frédéric CHALMEL Directeur de Recherche à l'Inserm, Université de Rennes, IRSET
• Nathalie GABORIT Directrice de Recherche CNRS, Nantes Université, Institut du Thorax
• Jean MOSSER PU-PH, Université de Rennes, Inserm OSS
• Paul PEIXOTO Maître de conférences, Université Marie-et-Louis-Pasteur, Inserm RIGHT

Résumé du manuscrit : Épigénomique et criblage génétique pour l’étude des pathologies

Le manuscrit présente le parcours scientifique d'Aurélien Sérandour, structuré autour de l’analyse des mécanismes moléculaires impliqués dans les états pathologiques. Les travaux s’inscrivent dans une démarche intégrative visant à relier l’organisation de la chromatine, la régulation transcriptionnelle et les phénotypes cellulaires.

Un premier axe est consacré à l’étude de l’épigénome, et en particulier de l’hydroxyméthylome, en tant que marqueur fonctionnel de la régulation transcriptionnelle. Le développement et l’application de méthodes de cartographie à haute résolution m’a permis de caractériser le rôle de la 5-hydroxyméthylcytosine dans l’identification de régions régulatrices actives et dans la structuration des programmes transcriptionnels, notamment dans le myélome multiple.

Un second axe porte sur l’analyse mécanistique des interactions entre la chromatine et les facteurs de transcription, à l’aide d’approches combinant ChIP-seq, ChIP-exo et protéomique, permettant de relier organisation chromatinienne et contrôle transcriptionnel.

Enfin, ce manuscrit développe des approches de génétique fonctionnelle reposant sur des criblages CRISPR appliqués à des contextes infectieux et tumoraux, afin d’identifier des gènes et des voies impliqués dans le comportement cellulaire. L’ensemble de ces travaux témoigne d’une trajectoire scientifique cohérente et de l’acquisition d’une autonomie complète dans la conduite de projets de recherche.